W ramach chirurgii stomatologicznej wykonuje się zabiegi operacyjne w obrębie jamy ustnej. Ich celem może być usunięcie ognisk zakażeń czy rekonstrukcja tkanek miękkich lub twardych. Zabiegi chirurgiczne bardzo często są również wsparciem dla innych dziedzin stomatologicznych takich jak endodoncja (leczenie kanałowe) czy periodontologia.